在知网中，查重时会考虑论文的脚注和序号。一般情况下，脚注和序号不会被算入文本相似度的比较范围，因为它们通常是引用或标注其他文献的内容。但是，一些特殊情况下，脚注和序号的相似度也会被考虑，比如脚注中的文字内容与其他文献相似度较高，这时可能会被算入相似度比较的范围。因此，在写作过程中，建议尽量避免直接复制其他文献的脚注内容，以免影响论文的原创性。

此外，对于知网查重中的脚注和序号，还需要注意论文格式的规范性，确保脚注和序号的标注符合学术规范，避免因为格式错误而被误判为抄袭。在提交论文前，建议作者对脚注和序号进行仔细核对和排版，确保符合学术规范，以避免不必要的查重问题。